Aujourd'hui étudiant en Master de Politiques publiques à l'université Paris-Est Créteil, Etienne Matignon entre dans l'enseignement supérieur en 2016 dans une licence de Sciences pour la Santé à l'université Paris Descartes. En parallèle de ses études, il s'engage d'abord en 2017 dans l'association de sa licence, l'Amicale Paris Sciences avant de devenir président de la Fédération Nationale des Étudiants en sciences exactes, naturelles et techniques en 2018.
En 2019, il est élu au Conseil d'Administration de la nouvelle université expérimentale Université de Paris dont il devient le vice-président étudiant en 2020. Les élections CNESER de 2021 le voient candidat puis élu pour la FAGE avant d'intégrer le Bureau National de la FAGE au poste de vice-président chargé des affaires académiques avant de devenir Président de la FAGE en septembre 2022.