Docteur en musicologie (1995), Marc Vanscheeuwijck enseigne à l'Université de l'Oregon (USA) depuis 1995. Il y est professeur associé de musicologie, directeur du département « Musicology, Ethnomusicology & Historical Performance Practice » depuis 2006 et titulaire de la Chaire « Musicology and Historical Performance Practice ». Il a également été professeur invité dans différentes universités (Zagreb, Évora, Alcalá de Henáres) et conservatoires (Bruxelles, La Haye, Paris, Berlin, Leipzig, Zagreb, Brno, Prague, Lisbonne, Madrid et Bologne).
Ses recherches traitent notamment de la musique sacrée des XVIIe et XVIIIe siècles en Italie, du Baroque en tant que concept esthétique, de l'organologie et iconographie musicale entre le XVIe et le XVIIIe siècle, du violoncelle baroque, etc.
En termes d'évaluation, Marc Vanscheeuwijck a développé l'évaluation interne des programmes de son département et a ensuite coordonné les réformes apportées à ces mêmes programmes.